知识图谱

洞察生物医学知识网络

基于图数据库与大语言模型,实现可解释、可追溯的智能知识发现

主要功能与特色

知识图谱平台提供全方位的生物医学知识管理与智能发现能力

🔍

知识图谱可视化

提供力导向图、层次布局等多种视图,支持图谱的缩放、拖拽、聚焦、高亮等交互操作,直观呈现复杂的实体关联网络。

🧭

路径探索发现

支持输入两个实体(如"BRCA1"和"乳腺癌"),快速查找并展示两者之间的所有关联路径,助力发现隐藏的生物医学机制。

🤖

智能问答系统

基于大语言模型和知识图谱,支持自然语言提问,返回结构化三元组答案,并附带原始文献证据句子,实现答案可解释、可追溯。

📚

文献数据集成

内置PubMed检索功能,支持关键词搜索、多维度筛选。无缝对接PubTator3,自动解析文献中的基因、疾病、化合物等实体。

📄

单文献深度解析

针对单篇文献,展示其专属的知识子图,支持对实体和关系的可视化编辑,让专家知识可以便捷地沉淀到系统中。

🔄

全生命周期数据管理

支持节点类型管理、关系类型管理、节点数据管理与关系数据管理,提供表格形式的批量增删改查和筛选验证功能。

📊

统计分析看板

动态展示节点总数、关系总数、文献总数等核心指标,通过饼图、柱状图、折线图直观呈现数据分布和增长趋势。

📤

数据导入与导出

支持从PubTator3标准格式导入数据,支持将问答结果、节点列表、关系列表导出为JSON、CSV、Excel等通用格式。

产品架构

前后端分离的微服务架构,由数据层、服务层、应用层和展示层四部分组成

1

展示层

基于Web的交互式界面,支持主流浏览器访问。采用图形渲染引擎(如Three.js/Cytoscape.js)实现大规模图谱的高性能渲染,提供流畅的用户交互体验。

2

应用层

实现知识图谱可视化、智能问答、统计报表、文献管理、数据管理(节点/关系/类型)等核心业务逻辑。

3

服务层

包含图谱查询服务、全文检索服务(基于Elasticsearch)、LLM推理服务、数据管理服务、用户认证服务等核心微服务模块,通过API网关进行统一路由和权限校验。

4

数据层

基于图数据库(如Neo4j)和关系型数据库(如PostgreSQL)混合存储。图数据库用于存储实体-关系网络,关系型数据库用于存储文献元数据、用户信息、操作日志等。数据通过ETL管道从PubMed、PubTator3等公开数据源定时更新。

核心数据指标

🔵
1,234,567
节点总数
🔗
5,678,901
关系总数
📄
123,456
文献总数
🏷️
50+
节点类型

适用领域和行业

知识图谱平台赋能多领域生物医学研究与产业应用

💊

制药企业与生物技术公司

用于靶点发现、机制研究、药物重定位、竞争情报分析,辅助研发决策。

🏥

医院与临床研究机构

用于挖掘基因-疾病-药物关联,辅助临床诊断、个性化治疗方案研究和科研论文发表。

🎓

科研院所与高校

作为生物医学信息学、计算生物学的研究平台,用于数据挖掘、知识发现和教学演示。

🔬

CRO/CDMO服务商

提升数据分析和情报挖掘能力,为客户提供更具深度的药物研发服务。

📈

投资与咨询机构

用于评估生物医药领域的技术管线、专利布局和投资价值。

传染病知识图谱

基于图数据库的传染病多维知识关联网络 — 涵盖8种核心传染病、7大知识维度

路径智能问答

基于图路径检索关联文献,驱动大语言模型进行精准知识问答

图中任意两节点间可检索关联文献并触发问答
SFTsvIL6
知识图谱LLM问答

问答示例:

请解释当前路径的生物学意义
总结当前路径下的所有文章
这些文章的主要研究方法是什么?
当前路径涉及哪些关键分子?
这些研究有哪些临床意义?
当前研究领域的主要挑战是什么?